推荐亮点： 免疫检查点抑制剂等免疫疗法已经改变了晚期癌症的治疗方法，但只有一小部分患者长期对免疫检查点抑制剂有反应，且有副作用。研究人员开发了一种两步的方法，使用全外显子组测序来锁定基因和通路，从而预测癌症患者是否会对免疫治疗产生反应。研究人员结合了此前对黑色素瘤、肺癌、膀胱癌和头颈癌患者进行的六项免疫治疗研究的数据。所有接受免疫检查点抑制剂(anti-PD-1或anti-CTLA-4)治疗的参与者均可进行全外显子组测序。研究人员采用一种名为fishHook的模型，该模型将导致癌症的突变与背景突变(即偶然发生但与癌症无关的突变)区分开来。首先，他们根据所有患者的全外显子组测序，寻找任何突变负担高于他们预期的基因，找到了了6个具有可疑的高突变负担的基因。研究人员确定这六种基因 (BCLAF1, KRAS, BRAF, TP53，以及信号通路MAPK和p53)中是否有任何一种在对免疫治疗有反应或没有反应的人身上富集。他们将这六种基因与其他预测变量(如年龄、肿瘤类型和肿瘤突变负荷)结合起来，创建了一种命名为癌症免疫治疗反应分类器(CIRCLE)的工具。与仅分析肿瘤突变负荷的预测结果相比，该工具对免疫检查点抑制剂反应的预测灵敏度高10.5%，特异性高11%。结果表明，使用更广泛的诊断方法，如全外显子组甚至全基因组测序，可能会显著提高对免疫治疗反应的预测能力。未来的研究将涉及更多的、接受了不同免疫疗法的患者的测序数据，为癌症免疫治疗提供更好的预后工具铺平道路。

原文：

https://www.nature.com/articles/s41467-022-31055-3.pdf

DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-022-31055-3